1. Приоритетное направление: РАН – 1.4. Радиофизика и электроника, акустика; СО РАН - 12. Астрономия, исследование околоземного космического пространства. Научная программа: РАН – 1.4.8. Радиофизические методы диагностики окружающей среды; СО РАН - 12.3. Физика атмосферы и окружающей среды (2004-2006).
2. Приоритетное направление: СО РАН – 2.5. Современные проблемы радиофизики и акустики. Научная программа: СО РАН – 2.5.1. Радиофизические методы диагностики окружающей среды (2007-2009).
3. Приоритетное направление: СО РАН II.8. Актуальные проблемы оптики и лазерной физики. Научная программа: СО РАН II.8.3. Фундаментальные проблемы оптики и дистанционного зондирования атмосферы (2010-2012).
4. Приоритетное направление II.9. Физическое материаловедение: новые материалы и структуры, в том числе фуллерены, нанотрубки, графены, другие наноматериалы, а также метаматериалы. Программа II.9.3. Полифункциональные наноструктурированные композитные материалы, развитие технологий их получения (2013-2020).
- Проект «Теоретические и экспериментальные исследования некоторых типов волновых процессов в природных и искусственных средах» (Н.р. Бороноев В.В. 2004 – 2006);
- Проект «Анализ периодических структур и волновых процессов в природных и искусственных средах» (Н.р. Бороноев В.В. 2007 – 2009);
- Проект «Моделирование волновых процессов в природных и искусственных средах» (Н.р. Бороноев В.В. 2010 – 2012);
Проект II.9.3.3. Физические характеристики, структурные особенности и функциональные свойства композитных материалов (раздел 4: Волновая диагностика биоструктур (Н.р. Номоев А.В. 2013-2020).